Σκοποί

Το Μουσείο αποτελεί κοινωφελές νομικό πρόσωπο που ανήκει στο Ελληνικό δημόσιο και εποπτεύεται από τον Υπουργό Πολιτισμού (Ν. 2260/1994).

Το Μουσείο έχει ως σκοπό:

«τη μελέτη, έρευνα, ανάδειξη, έκθεση, συντήρηση, φύλαξη και κάθε πρόσφορη αξιοποίηση του απολιθωμένου δάσους Λέσβου», όπως ορίζει η παράγραφος 2 του άρθρου 2 του Ν.2260/94. 
 
Ειδικότεροι σκοποί του Μουσείου, όπως αυτοί προσδιορίσθηκαν από το Διοικητικό Συμβούλιο, είναι:

• η έρευνα και ανάδειξη των στοιχείων που συνθέτουν τη γεωϊστορική εξέλιξη του χώρου στον οποίο αναπτύχθηκε το Απολιθωμένο Δάσος καθώς και η  συγκριτική μελέτη των σύγχρονων και απολιθωμένων οικοσυστήματων, με στόχο την κατανόηση και ανάδειξη της αξίας και σημασίας του Απολιθωμένου Δάσους
• η εκθεσιακή παρουσίαση, ανάδειξη και προβολή των ευρημάτων του
• η διαχείριση, προστασία και ανάδειξη του Απολιθωμένου Δάσους
• η προστασία της γεωποικιλότητας και της βιοποικιλότητας, των βιοτόπων και γεωτόπων, των τοπίων και γενικότερα του φυσικού περιβάλλοντος
• η περιβαλλοντική εκπαίδευση.
• η πολιτιστική και οικονομική ανάπτυξη της περιοχής.